16支资格赛第三轮的胜者（第一回合在8月10－11日进行，第二回合在8月24－25日进行）将参加欧洲顶级的俱乐部赛事冠军联赛小组赛的比赛。

资格赛第三轮种子队：意大利国际米兰、西班牙皇家马德里，英格兰曼彻斯特联队、英格兰利物浦、西班牙拉科鲁尼亚、意大利尤文图斯、荷兰PSV埃因霍温、德国勒沃库森、法国摩纳哥、比利时安德莱赫特、苏格兰格拉斯哥流浪者、希腊萨洛尼卡、乌克兰基辅迪纳摩、捷克布拉格斯巴达同塞浦路斯尼科西亚阿普尔的胜者、比利时布鲁日同保加利亚普拉迪夫火车头的胜者、挪威罗森博格同摩尔多瓦谢里夫的胜者

非种子队：葡萄牙本菲卡、瑞士巴塞尔、奥地利格拉兹风暴、以色列海法马卡比、捷克俄斯特拉发、格鲁吉亚WIT同波兰维斯拉克拉科维亚的胜者、瑞士伯尔尼小男孩同塞黑贝尔格莱德红星的胜者、乌克兰顿涅茨克同亚美尼亚埃里温皮尤尼克的胜者、斯洛文尼亚戈里察同丹麦哥本哈根的胜者、芬兰赫尔辛基同以色列特拉维夫马卡比的胜者、阿尔巴尼亚KF地拉那同匈牙利费伦斯的胜者、克罗地亚斯帕拉托哈伊杜克同爱尔兰谢尔伯恩的胜者、罗马尼亚布加勒斯特迪纳摩同斯洛伐克MSK斯利纳的胜者、拉脱维亚斯孔托同土耳其特拉布宗体育的胜者、阿塞拜疆巴库同俄罗斯莫斯科中央陆军的胜者、瑞典尤尔加登同立陶宛考纳斯的胜者